І в зрілому віці у Распутіна зберігався винятковий дар провидця. Так, його секретар і довірена особа Симанович підтвердив, що знамените пророче лист було написано «старцем» в останні тижні 1916 року: в ньому Распутін точно передбачив свій неминучий кінець і звернувся зі зловісними словами, адресуючи їх в першу чергу Миколі II.
«Старець» передчував, що не доживе до 1 січня, і попереджав царя: якщо той почує похоронний дзвін по убієнному Григорію і якщо це буде зроблено руками його родичів, то ніхто з царської сім’ї не проживе більше двох років: вони будуть знищені російським народом.
Распутіна дійсно вбили наприкінці грудня 1916 року, а організатором змови був князь Фелікс Юсупов (Фелікс Феліксович Юсупов (1887-1967), князь. Його батько, граф Сумароков-Эльстон, отримав від імператора право користуватися титулом дружини, княгині Зінаїди Юсупової. Фелікс Юсупов помер в еміграції.). Цей молодий аристократ був спадкоємцем найбільших приватних земельних володінь в Росії і був одружений на великій княжні Ірині (Велика княжна Ірина Олександрівна була дочкою великого князя Олександра Михайловича і великої княгині Ксенії Олександрівни, сестри Миколи II.), улюбленої племінниці імператора.
У Юсупова було безліч причин ненавидіти лжестарца: його батько, генерал-губернатор Москви, був відсторонений від посади в 1915 році, очевидно, не без втручання Распутіна. Губернатор, виявивши, що усюди панують шпигунство і зрада, насмілився вирушити в Ставку і без прикрас викласти царю ситуацію, що виникла в Москві. До того ж мати Юсупова, чарівна княгиня Зінаїда, обурена зростаючим впливом «старця» при дворі, кілька разів говорила про це з імператрицею, але домоглася лише того, що нажила собі в її обличчі ворога. У момент вбивства «старця» батьки князя жили в Криму, в свого роду добровільному засланні.
Для здійснення свого плану молодий Юсупов заручився підтримкою Пуришкевича, депутата Думи вкрай правого спрямування. Пуришкевич, так званий «патріот» і затятий антисеміт, здобув популярність завдяки скандальним сцен, які йому вдавалося провокувати в залі засідань: це була унікальна особистість останнього періоду царизму, для нього не існувало ніяких гальм, ні моральних, ні інтелектуальних. Третім змовником був великий князь Дмитро Павлович (Син великого князя Павла Олександровича, брата імператора Олександра III.), двоюрідний брат царя, великий друг і шанувальник Юсупова; його участь могла зменшити ризик ймовірного покарання, оскільки в Росії князі царської крові не могли бути притягнуті до звичайної судової відповідальності. Дмитро Павлович міг постати перед судом лише самого імператора; до того ж його причетність до справи надала б деякий блиск всьому підприємству.
Вбивство «старця» було для Юсупова справою, гідним схвалення, і мало прямо-таки містичний зміст: палкому уяві князя уявлялося, що він покликаний звільнити світ і російський двір від присутності диявольського кодла, від чудовиська, навіть не має права на існування. Ми не бачимо сенсу переказувати зараз всі похмурі обставини повільною і жорстокої смерті Распутіна, з усіма численними і жахливими подробицями: це вже детально викладено Юсуповим в його мемуарах. Незвичайна фізичне загартування, здавалося, зробила Григорія безсмертним, і змовникам довелося здійснити практично три вбивства: в ту страшну ніч «старця» спочатку отруїли, потім вбили кількома кулями і, нарешті, скинули — ще живого — у вкриту льодом Неву. Коли через три дні труп був виявлений, його легені були наповнені водою — доказ того, що жертва загинула, потонувши в річці.
Распутін був похований в одному з куточків імператорського парку в Царському Селі, де згодом Анна Вирубова (Ганна Олександрівна Вирубова, уроджена Танєєва, була найближчою подругою Олександри Федорівни. Вона жила в невеликому будиночку в царськосільському імператорському парку і була посередницею між царицею і Распутіним. Після зречення Миколи II вона була ув’язнена в Петропавловську фортецю. Померла в еміграції.), придворна інтриганка і подруга цариці, збудувала на свої гроші каплицю. Перш ніж труну був закритий кришкою, Олександра Федорівна попросила, щоб на груди «се старця» поклали ікону з підписами всіх членів сім’ї і лист:
«Мій дорогий мученик, дай мені твоє благословення, щоб воно постійно було зі мною на скорботному шляху, який залишається мені пройти тут на землі. І пом’яни нас на небесах у твоїх святих молитвах.
Олександра».
Але Распутін, ще раз демонструючи свій пророчий дар, передрік, що буде убитий і його тіло не знайде спокою: його спалять, а прах розвіють.
У березні 1917 року, коли Петроград переживав смутний час, група солдат увірвалася в імператорський парк у Царському Селі; вони розрили могилу Распутіна, витягли труну і відкрили його. Полковник Кобилинський (Кобилінський Євген Степанович, полковник. У 1927 р. був заарештований і розстріляний.), призначений в той час комендантом царскосельских палаців, описав у своїх свідченнях, даних в 1919 році, продовження цих подій: йому доручили особисто переправити тіло «старця» на Середню Рогатку, щоб там його поховати. Кобилинському порадили також робити все у глибокій таємниці, але обставини змінилися, і в результаті труну був спрямований у бік Петрограда. Однак місцеве населення дізналося про це новому плані, з’явилася загроза, що натовп знову може заволодіти тілом. Тоді Купчинський, який супроводжував тіло, вирішив спалити його в дорозі. Моторошна деталь: тіло Распутіна облили бензином, точно так само, як згодом надійшли з трупами Романових.