Герберт Вольфарт почав свою морську службу у квітні 1933 року. Після звичайного теоретичного освіти він більше року отримував практичні морські навички на борту крейсера (кишенькового лінкора) «Admiral Graf Spee». З травня 1937 року він перейшов в підводний флот і, як і багато відомі аси-підводники, отримав хорошу тактичну підготовку під безпосереднім керівництвом самого Деница. Після кількох місяців перебування в резерві 3.U флотилії Lohs, Вольфарт у вересні 1938 року був призначений першим помічником на підводний човен U-16.
19 жовтня 1939 року він вступив у командування човном U-14. За свої перші три бойових патрулювання Вольфарт потопив 9 судів абсолютно нікчемного водотоннажності (катери, шхуни) у водах Шотландії та Норвегії. А четверте патрулювання виявилося взагалі «ніяким» — U-14 взяла участь в операції «Хартмут» (підтримка з моря захоплення Норвегії) і не домоглася жодних результатів.
11 червня 1940 року Герберт Вольфарт був переведений командиром U-137 тієї ж серії НВ, що та його колишня човен. U-137 виявилася для Вольфарт більш щасливим: за 3 бойових походу восени 1940 року він потопив 7 суден противника (в основному, в районі Гибридских островів) загальною водотоннажністю 25465брт. Серед інших перемог слід відзначити успішну атаку англійської допоміжного крейсера «Cheshire» (10552т), який у результаті був тяжко пошкоджений і ремонтувався більше 6 місяців.
На глибині 10 метрів Вольфарт, вирівнявши човен, підняв перископ. Глянувши на нього, він ледве міг повірити своїм очам. В окулярі перебував легендарний авіаносець «Arc Royal» з літаками «суордфиш» на палубі. Авіаносець йшов прямим курсом (без зигзага) і не мав охорони з есмінців. На траверзі авіаносця перебував лінкер (Вольфарт помилково прийняв його за «King George V», що можна пробачити з урахуванням погоди і видимості, насправді це був лінійний крейсер «Renown»), також йде без охорони прямим курсом.
Це була ситуація, про яку будь-який командир підводного човна може тільки мріяти. «Я міг зайняти позицію між ними і вразити обидва корабля одночасно, — записав Вольфарт у вахтовому журналі (і це було не пусте хизування, бо Вольфарт належав до числа досвідчених і влучних командирів). — Якщо б у мене збереглися торпеди». Але всі свої торпеди він витратив на судна конвою НХ-126. Як він шкодував, що не послухався свого штурмана і витратив останню торпеду на відсталу від конвою мотлох!
Командир безпорадно дивився в перископ, як величезні кораблі проходять не більш ніж в 200 метрах від його торпедних апаратів, мовчки провівши їх поглядом, поки могутні кораблі супротивника не зникли вдалині. Тому у нашому дослідженні Вольфарт фігурує не як командир, торпедировавший авіаносець, а як підводник, який знищив «Darlington Cort» (50006рт).
Подальша історія потоплення «Bismarck» загальновідома. Через брак палива Вольфарт не міг йти на зближення з лінкорів, але з світанком він виявив неподалік U-74 Кентрата. Кентрат не міг вийти в атаку із-за ушкоджень, заподіяних глибинними бомбами, але він мав ще достатньо палива, щоб залишитися спостерігати за подіями. Обидві підводні човни зблизилися на відстань голосового зв’язку, і Вольфарт показав напрямок, в якому знаходився «Bismarck». Він побажав Кентрату удачі, а потім з важким серцем розгорнув U-556 в напрямку Лорьяна і зник з поверхні моря. При економічній роботі дизелів і електромоторів палива у нього ледь вистачало, щоб дістатися до Франції.
U-556 повернулася в базу на останніх краплях пального. Вставши біля пірсу Вольфарт з’ясував, що у нього залишилося 80 літрів солярки. Наступного дня, 15 травня 1941 року на борт човна піднявся адмірал Деніц і в урочистій обстановці вручив Вольфарту Лицарський хрест.
19 червня 1941 року Герберт Вольфарт вийшов у друге патрулювання на борту U-556, але вже 8 днів потому його човен була потоплена в Північній Атлантиці, на південний захід від Ісландії британськими корветами «Nasturtium», «Celandine» і «Gladiolus». Командир і більша частина екіпажу потрапили в полон. Герберт Вольфарт провів понад 6 років в англійських і канадських таборах для військовополонених і повернувся назад в Німеччину тільки 14 червня 1947 року.